Pärast seriaali lõppu otsustas Flockhart kätt proovida suurel ekraanil, kuid ükski film, kus tema kaasa lõi, ei saavutanud suurt edu. Mõneks aastaks taandus Flockhart näitlemisest täielikult.

2006. aastal naases naine seriaalimaailma ning sai rolli sarjas "Vennad ja õed". Kitty Walkerit kehastanud näitlejatar püsis seriaalis selle lõpetamiseni 2011. aastal.

Calista Flockhart ja Harrison Ford 2018. aasta sügisel.

Viimastel aastatel on ta kaasa teinud seriaalis "Supergirl" ning andnud hääle mitmetele multikategelastele.

Abielust Fordiga on Flockhartil adopteeritud poeg Liam, kes saab sel aastal täisealiseks.